免费查重网站保护用户隐私的关键在于技术手段和隐私政策。首先，这些网站会采用加密传输技术，确保用户上传的文档在传输过程中不会被窃取或篡改。其次，免费查重工具通常会对用户上传的文本进行匿名化处理，即使是管理员也无法直接查看用户的文档内容。此外，合规的免费查重网站会明确规定用户数据的使用范围，并承诺不会将用户数据用于其他商业用途，保障用户隐私权益。

另外，用户在使用免费查重网站时也可以通过一些自我保护措施来提升隐私安全。比如，在上传敏感文档之前，可以先对文档进行适当的匿名化处理，删除个人信息或涉密内容。同时，选择信誉良好、口碑好的免费查重工具，避免使用未知来源的工具，可以有效降低隐私泄露的风险。总的来说，免费查重网站通过技术手段和隐私政策保护用户隐私，而用户也需要提高安全意识，共同维护隐私安全。