免费查重软件在保障安全性方面有多重措施。首先，采用加密传输技术，确保用户上传的文档在传输过程中不会被窃取；其次，严格限制员工权限，保障用户数据不被滥用；另外，定期更新安全防护措施，及时修补漏洞，确保系统安全稳定。此外，免费查重软件会对用户数据进行匿名化处理，保护用户隐私。用户在使用免费查重软件时，也应注意保护个人信息安全，避免泄露重要数据。

除了软件自身的安全性保障措施，用户在选择免费查重软件时也应该注意一些安全问题。首先，要选择知名度高、口碑好的免费查重软件，避免使用一些来源不明的软件，以免造成安全隐患；其次，定期更新软件版本，及时修复已知的安全漏洞；另外，在使用免费查重软件时，不要随意下载陌生插件或软件，以免被恶意软件侵入系统。总的来说，免费查重软件的安全性取决于软件本身的安全措施和用户的使用习惯，双重保障才能确保数据安全。